MHCflurry使用MHCnames软件包标准化等位基因名称

Biotech

发布日期: 2021-01-24

作者: InImpasse

文章字数: 156

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MHCflurry使用mhcnames 软件包标准化等位基因名称

HLA-A0201或A02:01将被规范化为HLA-A 02:01

Takes an allele name and splits it into four parts: 取一个等位基因名，把它分为四个部分

    1) species prefix 物种的前缀

    2) gene name 基因的名字

    3) allele family 等位基因家族

    4) allele code 等位基因代码

  For example, in all of the following inputs:

    "HLA-A*02:01"

    "A0201"

    "A00201"

  The result is a AlleleName object. Example:

    AlleleName(

      species="HLA", # species prefix

      gene="A",  # gene name

      allele_family="02",  # allele family

      allele_code="01",  # allele code

    )